Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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