Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms