Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms