Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms