Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA2D1P54289 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms