Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AP3M2P53677 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms