Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN1P49768 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms