Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NESP48681 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NESP48681 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NESP48681 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NESP48681 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NESP48681 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NESP48681 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NESP48681 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms