Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms