Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GJB2P29033 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms