Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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