Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TFE3P19532 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TFE3P19532 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms