Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKMT2P17540 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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