Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMP1P01033 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms