Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG7O95352 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms