Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DENRO43583 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms