Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DTX4Q9Y2E6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms