Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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COPS7AQ9UBW8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
COPS7AQ9UBW8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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