Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms