Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CNIH4Q9P003 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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