Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms