Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MCMBPQ9BTE3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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