Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MMP19Q99542 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP19Q99542 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms