Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms