Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms