Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms