Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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