Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD40Q6AI12 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms