Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms