Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXD4L6Q3SYB3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L6Q3SYB3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms