Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms