Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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