Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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