Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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