Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms