Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RSU1Q15404 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms