Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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