Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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