Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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