Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CALCOCO2Q13137 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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