Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms