Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSRP1Q08945 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms