Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX4Q06945 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms