Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms