Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BNC1Q01954 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms