Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HSF1Q00613 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms