Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms