Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN10P78369 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms