Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASIC1P78348 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms