Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVPABLB-1P60509 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms